Chaque zone occupe environ un étage de 1000 mètres. En général, la température baisse d'un degré tous les 200 mètres et les chutes de neige augmentent de 15 cm  tous les 100 mètres. A l'inverse la pluie décroît avec l'altitude.

Quelque soit la voie empruntée, les trekkeurs passent par les différents étages de l'écosystème du Kilimandjaro.

On distingue :

1. Les cultures entre 800 et 1800 mètres : sylviculture, café, banane... Cet étage est habité par les petits mammifères comme les galagos et les damans des arbres ainsi que de nombreuses espèces d'oiseaux comme les souimangas bronzés.
2. La forêt entre 1800 et 2800 mètres. Différentes formes de forêt ont été définies : la forêt pluviale, la forêt sèche, la forêt de nuages, la forêt de brouillard. C'est le terrain de jeu du colobe guereza, du singe bleu, des célapholes, dik-diks, guibs d'eau et calaos à joues argentées.
3. La lande entre 2800 et 4000 mètres est habitée de bruyères, séneçons et lobélies géants. Ce milieu n'est pas habité par beaucoup d'espèces animales (buffles, élands, éléphants, buses augure...) bien que certains mammifères transitent par cette zone pour rejoindre Amboseli au Kenya (Eléphants, lions, léopards, hyènes...).
4. La zone alpine entre 4000 et 5000 mètres caractérisée par une végétation rabougrie en raison des écarts thermiques importants entre le jour et la nuit (40 °C). De plus la gélifraction empêche l'enracinement de graines : l'alternance du gel et du dégel fait que la nuit de fines aiguilles de glace remontent du sol et pointent à la surface faisant remonter les petits cailloux; lors du dégel ces aiguilles rentrent dans la terre, c'est ce qu'on appelle la solifluxion (charriage et criblage du sol). Dans cette zone ne poussent que des mousses, lichens et quelques maigres touffes d'herbes.
5. Au dessus de 5000 mètres et jusqu'au sommet, c'est le domaine des neiges éternelles et des glaciers. Un léopard, gelé au pied du Kibo, fut découvert en 1926. Aujourd'hui, le lieu porte son nom (leopard point). Le froid est si intense et l'oxygène si rare que peu de plantes arrivent à pousser.Seuls quelques lichens arrivent à s'accrocher au sol.

Pour aller plu loin :

1. Parc National du Kilimandjaro
2. Climat du Kilimandjaro
3. Des ressources forestières en perdition